La tsikoudia se hace con el orujo que sobra del prensado de las uvas: pieles, semillas y restos de pulpa. El orujo fermenta y va al alambique, donde se destila. Como en otras aguardientes de orujo, el destilador separa la primera parte, la “cabeza”, y la última, la “cola”, y guarda el “corazón”, la parte del medio. En Creta, la bebida se hace sin anís y queda transparente.
La indicación geográfica Tsikoudia de Creta está en la lista oficial de bebidas espirituosas griegas y cubre toda la isla. En Creta, la misma bebida también se llama raki, nombre que no debe confundirse con el rakı turco, que lleva anís.
La destilación ocurre en otoño (septiembre a noviembre), después de la vendimia y de la producción del vino, y se extiende hasta noviembre. El turismo de la Región de Creta describe los calderos humeantes en los pueblos por esa época y la protoraki, la primera tsikoudia que sale del alambique, de graduación muy alta. Los días de destilación, llamados rakokazana o kazanemata, reúnen vecinos y parientes alrededor del alambique, con comida y música, sobre todo en los pueblos de la región de Rethymno.
En la mesa, la tsikoudia se sirve fría, en vasos pequeños, con bocadillos. Se ofrece como bienvenida al visitante y también llega al final de la comida, con frutas o un dulce.